Medtem ko se je odprava organizirala februarja 1804 na bregovih reke Mississippi, je William Clark pisal starejšemu bratu Jonathanu, na katerega se je prišel zanašati na vodenje in svetovanje. Dvajset let starejši od Williama, je bil Jonathan podpolkovnik v revolucionarni vojni in britanski vojni ujetnik od 1780 do 1781. Šele po Jonathanovi paroli leta 1781, ko se je vrnil domov, je prestal preostanek vojne, bratje so se dobro spoznali. Kot najstarejši desetletni brat Clark je Jonathan postal mlajši moški nekaj očetove figure. Ko je William oktobra 1803 zapustil Indiano z novomeškim Corps of Discovery, je Jonathan dva dni preživel z njim, ko je potoval s kobilico po reki Ohio.
V tem pismu, ki ga je prevzel iz Draga brata, zbirke pisem Williama Clarka, ki jo je uredil James J. Holmberg, William pripoveduje Jonathanu o dogodkih, ki vodijo do prenosa Louisiana Territoryja iz francoske in španske vlade na ameriško oblast, ki bi se zgodil marca 9, 1804, v St. Louisu. (Uradna slovesnost prenosa zemljišča, ki je trajala 21 dni, je bila v New Orleansu konec leta 1803.) Louisiana Nakup je seveda spremenil naravo odprave iz prikritega iskanja severozahodnega prehoda v odprto skavtstvo trgovskih mest in prihodnjih naselij.
Dragi brat
St. Louis 25. Feby. 1804
Vaše pismo iz prvega januarja sem prejel objavo pred zadnjo in Moral bi vas napisati zadnji, vendar sem bil v tistem času Tako slabo, da nisem mogel .... Kapitan Lewis in jaz sem prišel k temu kratek čas pred tem, da bi [sic] uredili potrebne ureditve za našo pot do Missoureisa, ki bo naslednji teden že dobro,
Poročnik Govr. Ta teden je prejšnji teden od svoje vlade oddal naročila, naj to provanso predajo kapitanu Stoddardu Ajuntu iz Francoske republike in Comdta. da bi ZDA prejele kolonij za Saidske države .... na poročnici Govrs. je potekala velika večerja in porrada - danes zjutraj je kapitan Stoddard v imenu francoske republike vložil zahtevo in oddal odgovor od poročnik Govr. da bi pričakoval dostavo in določil čas čim prej .... kosili smo se kot včeraj s poročnikom Govrjem. najbolj hudomušna večerja in velika kompija. prikazan je bil odličen Deal formalnosti in parade_ Kapitan S [toddard] mi je pokazal vsa njegova naročila & c. kar namerava izdati, so takšni, kot jih zelo odobravam ....
Prosim, da me iskreno predstavite sestri John Mr. & Ms. Temple & the famame in verjemite mi, da bom imel več kot bratovski učinek Wm Clark