https://frosthead.com

Kako narediti dodo

Zapisnik urednika, 22. september 2009 : Beth Shapiro je ena izmed štiriindvajsetih posameznikov, ki sta jih Fundacija Johna D. in Catherine T. MacArthur izbrala za MacArthurjeve sodelavce iz leta 2009. Prejela bo „genialno donacijo“ v višini 500.000 USD.

Sorodne vsebine

  • Mladi inovatorji v znanosti in umetnosti
  • Zadnja beseda

Če želite izolirati dodo DNA, sledite tem korakom: najprej poiščite dodo kost, ki ni fosilizirala. To bi moralo biti enostavno. Med redkimi znanimi na svetu sta lobanja in leva noga, ki sta shranjeni v škatlah v drugem nadstropju Prirodoslovnega muzeja Univerze v Oxfordu. V lasti univerze so od leta 1683, približno v času, ko je umrl zadnji dodo. Ni velik muzej, toda če se izgubite, poiščite majhno ploščo ob vhodu v shrambo, kjer se je leta 1860 odvijala legendarna razprava o teoriji evolucije Charlesa Darwina.

Težki del, kot je odkrila biologinja Beth Shapiro leta 2000, bo prepričeval vodjo zbirk Malgosia Nowak-Kemp, da vam bo omogočil vajo do končnega neobnovljivega vira. Res je, da vam ne bo treba veliko uničiti - dovolj bi bil že drobec velikosti nohta pinkie - vendar je varno reči, da ne boste dobili druge priložnosti. Poskusi, da pritisk ne bo dopustil. "Tu je ta zelo znan vzorec, zelo omejen vir, kratek Američan pa pride in hoče od njega odnesti kos, " pravi Shapiro. "[Nowak-Kemp] se niti približno ni bal tako kot jaz."

Naslednji korak je verižna reakcija polimeraze. Za PCR je potreben dobro opremljen laboratorij za vse, od testov očetovstva do kloniranja. Preden stopite notri, si oblecite čisto obleko, kakršno najdete v tovarnah računalniških čipov, da ne boste onesnažili svojega vzorca s sodobno DNK.

Pripravljeni? V redu: dodo kost zmeljemo v fin prah. Raztopimo ga v raztopini na vodni osnovi. Zmešajte magnezijeve in DNK polimeraze - encime, ki pomagajo genom, da se sami kopirajo. Zmes segrejte na približno 150 stopinj Fahrenheita, da razbijete verige DNK na dva sklopa. Ohladite ga in pustite, da se encimi polimeraze prilepijo na dodojevo DNK in ustvarijo kopije. Ponovite vsaj 30-krat. Do jutra bi morali imeti epruveto z približno milijonom kopij dodo gena ali fragmenta gena.

31-letni Shapiro je ta zavajajoče preprost zveneč postopek dokazal uspeh. Ko je leta 1999 prišla na Oxford kot raziskovalka Rhodesa, se je vadila pri Alanu Cooperju, pionirju na popolnoma novem področju starodavne DNK. V šestih letih odkar se je Shapiro povzpel na vrh drobne, odmevne, nadvse mlade skupnosti raziskovalcev starodavnih DNK. Pred kratkim je sprejela službo v Penn Stateu, kjer bo začela poučevati to jesen.

Starodavne raziskave DNK analizirajo gene že zdavnaj mrtvih rastlin in živali - znanstvenikom omogočajo, da so natančno in nepredstavljivo natančno pred petimi leti izsledili razvoj in izumrtje vrst. Primer, s primerjavo dodo DNA z geni petih drugih vrst, je Shapirovo raziskovanje ugotovilo, da je ptica brez leta oddaljena sorodnica goloba. Njen prispevek v Science leta 2004 je trdil, da se je upadanje bizonov začelo veliko prej, kot se je domnevalo - pred približno 37.000 leti - in ga zato v Severni Ameriki niso povzročili predvsem lovci na ljudi. Lani je raziskava, v kateri je sodelovala pri genomu mamuta, dala namige njenemu najbližjemu sorodniku (slon, neprijetno).

Pred dvema letoma je Shapiro zamenjal Cooperja kot vodjo Oxfordovega centra za antične biomolekule Henry Wellcome v laboratoriju. Pred kratkim je začela izslediti mutacije virusa AIDS-a - nekakšne evolucijske študije na hitro. "Prestopi veliko meja, " pravi raziskovalec starodavnih DNK Ian Barnes z univerze v Londonu Royal Holloway. "Šteje se, da je ena izmed najboljših ljudi na tem področju z vidika svojih sposobnosti upravljanja številnih raziskav."

Prestopanje meja je najljubši način. Še v srednji šoli je Shapiro delal kot stremeč novinar oddaje za televizijsko postajo v Rimu v državi Georgia. Na fakulteti jo je spremljala kitajska mandarina, geologija, španska in angleška literatura, nato pa se je odločila za specialko iz ekologije. Doktorirala je iz Oxforda v samo treh letih doktorirala iz evolucijske biologije in še vedno našla čas za vodenje vinskega kluba univerze in gostovanje v lokalni radijski znanstveni oddaji.

Shapiro je prepotoval svet v iskanju vzorcev DNK, starodavnih in drugače. Večino je bilo veliko težje najti kot dodo kost. Na kanadskem ozemlju Yukon je med zbiranjem vzorcev za testiranje padla v 800 let staro gnojenje iz Caribouja; v Keniji je izmikala levom, da bi zgrabila zebrove iztrebke. Zbrala je volnene mamutne kosti iz Sibirije in bizonske ostanke z Aljaske. Lani poleti je odletela na otok Mauritius v Indijskem oceanu, da bi iskala neforsificirane dodo kosti, da bi jih primerjala z vzorcem iz Oxforda - brez uspeha.

Kot mnogi njeni kolegi tudi Shapiro parira veliko vprašanj o kloniranju; ideja o ponovnem ustvarjanju izumrle vrste je tako zelo mučna. Vendar pa je ogromno tehničnih izzivov, ki jih znanstveniki še morajo premagati: starodavna DNK ponavadi pride v veliko drobnih drobcev in brez žive živali ni mogoče rekonstruirati, kateri geni se bodo igrali v kateri fazi dodojevega razvoja. Skratka: brez dodo mame, brez dodo otroka.

Še pomembneje pa je, da se sprašuje, ali je vrnitev vrst v svet, kjer nimajo življenjskega prostora, smiselna. "Seveda je seksi in odmeven pomen o kloniranju izumrlih vrst, " pravi, "vendar je veliko več pomembnih prispevkov. Nevarnost je, da bodo ljudje leni in mislijo, da je kloniranje način za rešitev problema izumiranja. . " Namesto tega bo še naprej poskušala ugotoviti, zakaj so nekatere vrste izumrle. Upa, da lahko njene raziskave pomagajo preprečiti, da bi sodobne vrste stopile po poti.

Andrew Curry je pisal o naslikanih romunskih samostanih v Romuniji v junijski številki Smithsonian. Živi v Berlinu.

Kako narediti dodo