https://frosthead.com

Kako znanstveniki odločajo, katere genomi živali bodo zaporedni

Kaj imajo vse afriške krempljeve žabe, orangutani in koze? Genetiki so gledali globoko v svoje gene: Te vrste so imele zaporedje svojih celotnih genomov.

Sorodne vsebine

  • Kaj je res v roli tune? DNK testiranje vam lahko pomaga ugotoviti
  • Kaj pomeni biti vrsta? Genetika spreminja odgovor
  • To so tiste izumrle živali, ki jih lahko in bi jih morali oživljati

Morda ste že slišali za možnost, da bi svoj celoten genom zaporedoma uredili. Pred nekaj leti je cena zaporedja človeškega genoma padla na 1.000 dolarjev. To ni žepna sprememba, vendar niti 2, 7 milijarde ameriških dolarjev ne stane, da bi sledil prvi človeški genom. Z živalmi je vseeno bolj zapleteno. Ker še nihče od te vrste ni bil sekvenciran, je težje sestaviti genom brez kakršnih koli referenc.

Okrogla črva C. elegans je postala prva žival, ki je sekvencirala svoj genom, in sicer od leta 1998. Od takrat boljša tehnologija sekvenciranja genomov omogoča znanstvenikom prehod na bistveno bolj zapletene organizme in sekvenco opravijo veliko hitreje in učinkoviteje.

A še vedno je malo verjetno, da bodo znanstveniki kdaj zaporedili genom vsake živali. Izbrati morajo. Kje torej začeti?

Ni nobenega merila, po katerem bi bila ta odločitev sprejeta. Včasih gre za povečanje ozaveščenosti o vrsti in njeni potencialni koristi za človeštvo: To so bili razlogi, ki so jih dali raziskovalci z univerze v Singapurju, ko so zaprosili za financiranje zaporedja genoma viperke templjev v začetku tega leta, piše Samantha Boh za Singapore Times . Viper je "edina vrsta kač, za katero je znano, da proizvaja toksin, imenovan waglerin, " piše, "nevromuskularni zaviralec, za katerega znanstveniki verjamejo, da bi ga lahko razvili v mišično relaksalno zdravilo."

Poleg potencialnih medicinskih koristi sekvenciranja genomov je praksa, pomembna za osnovno znanstveno in zgodovinsko razumevanje sveta. "Genom genom živih vrst je zgodovinski odtis prilagodljivih dogodkov, ki so jih pripeljali tja, kjer so danes, " je na konferenci dejal Stephen O'Brien, vodja Laboratorija za gensko raznolikost.

Preučevanje sedanjih genomov živali lahko znanstvenikom pove o njihovi preteklosti kot vrsti in zgodovini okolij, kjer so živeli, in drugih vrstah, ki so živele z njimi. Na primer, genomi udomačenih živali lahko pomagajo razložiti preteklost človeštva. Tako ljudje kot živali, kot so krave in prašiči, so se spremenili (in se še naprej spreminjajo), ko se je del človeštva naselil in začel kmetovati. Preučevanje, kako so se razvijali, ko so se udomačili, pomaga genetikom, da razumejo dejavnike starodavne človeške evolucije, in lahko pomaga razložiti, kdaj so bile točno udomačene živali.

Genomi teh domačih živali lahko ponujajo tudi človeštvo. "Natančni referenčni genomi so pomembni za razumevanje biologije organizma, za spoznavanje genetskih vzrokov zdravja in bolezni ter pri živalih za sprejemanje odločitev o vzreji, " so zapisali v sporočilu Nacionalnega inštituta za človeški genom.

Včasih zaporedje živalskega genoma znanstvenikom pomaga, da ostanejo ostri. Kanadski raziskovalci, ki običajno delajo na človeškem genomu, so v letošnjem letu v praznovanju 150. rojstnega dne Kanade sekvencirali genom bobra. "Večina naših prizadevanj je na človeških genomih, " mi je povedal znanstvenik Stephen Scherer. "A pravzaprav nas intelektualno spodbudi, da pogledamo dlje od tega, kar počnemo." Ni škodilo, da je bober državni simbol Kanade. Ker so včasih dobri odnosi z javnostmi prav tako dober razlog.

papadum_goat.jpg Papadum, koza San Clemente, katere genom je bil rekonstruiran z novo tehniko v začetku tega leta. (Brian L. Sayre)
Kako znanstveniki odločajo, katere genomi živali bodo zaporedni